固定フロントページを作る

コレが一番スマートなんじゃないかなと思います。
toppage.php等のテンプレートを作成しておき、その後、ルートサイトの方で、固定ページを作成して、先ほど作ったカスタムページテンプレートを適用します。

その後、設定→表示設定から、フロントページの表示のところを、固定ページに変更し、フロントページの項目を先ほど作ったページに変更します。

子テーマを使う

子テーマを使って、home.phpやら、front-page.phpを上書きします。そして、子テーマの方をルートサイトの方のテーマにセットします。いまいち直感性に書けるかもしれません。

サイドバーが違う場合など、トップページの変更点が多い場合、こっちの方が良い場合もあります。

ページを作成しないで良いので、wp_list_pages等を普通に使えます。